В ночь на 3 июня по объектам в Ленинградской области и ряде других регионов нанесён налёт беспилотников. По словам губернатора Ленинградской области Александра Дрозденко, атака длилась с 2:00 до 7:00, за это время было сбито около 50 дронов; о последствиях он подробностей не привёл.
В Санкт‑Петербурге взрывы слышали в Адмиралтейском, Василеостровском, Приморском и Красносельском районах. В Кировском районе в результате попадания загорелся крупный нефтеперевалочный терминал — крупнейший в регионе терминал на Балтике с пропускной способностью около 12,5 млн тонн в год и множеством резервуаров хранения, имеющий стратегическое значение.
Атака совпала с днём открытия Петербургского международного экономического форума (3–6 июня), где ожидается выступление президента. Выставочный комплекс, где проходит форум, находится примерно в 17 км от пострадавшего терминала. На фоне налёта в аэропорту Пулково задержали более 29 рейсов.
Также в ночь на 3 июня под атакой оказался Мичуринск в Тамбовской области: в результате падения беспилотников получили повреждения многоквартирный дом, библиотека, школа искусств и хозяйственные постройки промышленного предприятия; пострадавших нет, сообщили региональные власти.
По имеющимся данным, одной из целей стала производственная площадка завода «Прогресс», выпускающего оборудование для систем управления авиационной и ракетной техники. Это предприятие ранее уже фиксировалось в числе объектов, подвергавшихся ударам.
Министерство обороны РФ заявило, что за прошедшую ночь над территорией страны было сбито 354 беспилотника. Системы ПВО осуществляли перехваты над 16 регионами, в том числе над Белгородской, Брянской, Воронежской, Калужской, Курской, Ленинградской, Новгородской, Орловской, Ростовской, Тульской и Московской областями.
С вечера 2 июня Росавиация ограничивала работу некоторых аэропортов: в том числе Внуково и Домодедово, а также авиаузлов Калуги, Саратова, Нижнего Новгорода, Ярославля и Пскова.